Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLIP4Q8N3C7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms