Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRIM48Q8IWZ4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRIM48Q8IWZ4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms