Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC103Q8IW40 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms