Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CATSPER4Q7RTX7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms