Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
UBE2R2Q712K3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms