Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM72Q6ZMU5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms