Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GDF6Q6KF10 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
GDF6Q6KF10 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GDF6Q6KF10 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GDF6Q6KF10 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
GDF6Q6KF10 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF6Q6KF10 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF6Q6KF10 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF6Q6KF10 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF6Q6KF10 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF6Q6KF10 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF6Q6KF10 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF6Q6KF10 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF6Q6KF10 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GDF6Q6KF10 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms