Protein–RNA interactions for Protein: Q5M7Z0

RNFT1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT1Q5M7Z0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RNFT1Q5M7Z0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RNFT1Q5M7Z0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RNFT1Q5M7Z0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RNFT1Q5M7Z0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RNFT1Q5M7Z0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RNFT1Q5M7Z0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RNFT1Q5M7Z0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RNFT1Q5M7Z0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT1Q5M7Z0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT1Q5M7Z0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT1Q5M7Z0 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RNFT1Q5M7Z0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT1Q5M7Z0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT1Q5M7Z0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT1Q5M7Z0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT1Q5M7Z0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT1Q5M7Z0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT1Q5M7Z0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT1Q5M7Z0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNFT1Q5M7Z0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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