Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ALFQ53S48 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms