Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TMEM259Q4ZIN3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TMEM259Q4ZIN3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms