Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED5Q49AG3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZBED5Q49AG3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms