Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RNF212Q495C1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms