Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SP6Q3SY56 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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