Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00303Q3SY05 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00303Q3SY05 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms