Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
KRTAP21-3Q3LHN1 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms