Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP2B3Q16720 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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