Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms