Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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CRY1Q16526 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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CRY1Q16526 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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CRY1Q16526 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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CRY1Q16526 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CRY1Q16526 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CRY1Q16526 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CRY1Q16526 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CRY1Q16526 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRY1Q16526 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CRY1Q16526 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CRY1Q16526 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CRY1Q16526 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRY1Q16526 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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