Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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SSX1Q16384 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SSX1Q16384 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SSX1Q16384 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SSX1Q16384 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSX1Q16384 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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