Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NTRK3Q16288 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NTRK3Q16288 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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