Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NEDD8Q15843 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NEDD8Q15843 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NEDD8Q15843 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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NEDD8Q15843 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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NEDD8Q15843 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NEDD8Q15843 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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