Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
TWIST1Q15672 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms