Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRADDQ15628 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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