Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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