Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PTPRCAPQ14761 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms