Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERV3-1Q14264 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms