Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KCNC3Q14003 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms