Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ALCAMQ13740 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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