Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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PEX6Q13608 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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PEX6Q13608 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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PEX6Q13608 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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PEX6Q13608 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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PEX6Q13608 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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PEX6Q13608 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PEX6Q13608 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PEX6Q13608 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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