Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AP001793.2-201ENST00000580267 780 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CAMK2BQ13554 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms