Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NME3Q13232 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NME3Q13232 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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