Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK3Q13003 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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