Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP3Q12983 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms