Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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BNIP1Q12981 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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BNIP1Q12981 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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BNIP1Q12981 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BNIP1Q12981 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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BNIP1Q12981 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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BNIP1Q12981 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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BNIP1Q12981 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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BNIP1Q12981 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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