Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
FOXD4Q12950 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms