Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRJQ12913 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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