Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIPAL4Q0D2K0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms