Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLFN5Q08AF3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms