Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TGM3Q08188 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms