Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
LRP1Q07954 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
LRP1Q07954 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms