Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP1-1Q07627 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms