Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FMODQ06828 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FMODQ06828 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FMODQ06828 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FMODQ06828 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FMODQ06828 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FMODQ06828 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FMODQ06828 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms