Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC18A2Q05940 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms