Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP7AQ04656 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP7AQ04656 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms