Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DSG1Q02413 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DSG1Q02413 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms