Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CDK16Q00536 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms