Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VLDLRP98155 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms