Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRB1P82279 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRB1P82279 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRB1P82279 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB1P82279 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB1P82279 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB1P82279 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB1P82279 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB1P82279 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB1P82279 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB1P82279 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB1P82279 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB1P82279 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB1P82279 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB1P82279 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB1P82279 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRB1P82279 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRB1P82279 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms