Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAE1P78406 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAE1P78406 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAE1P78406 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms