Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RPS4XP62701 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RPS4XP62701 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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